Jeison Fabián Murillo Cerón znany jako Murillo piłkarską karierę rozpoczął w rodzimej Kolumbii, gdzie w 2009 roku bronił barw Deportivo Cali. Kolumbijczyk karierę seniorską rozpoczął w Grenadzie, skąd został wypożyczony do Cadiz i Las Palmas. Po wygaśnięciu umowy zainteresował się nim Inter Mediolan, z którym Murillo podpisał pięcioletni kontrakt w czerwcu 2015 roku.
Na boisku Jeison gra na pozycji środkowego obrońcy i cechuje go bardzo dobra technika, dzięki czemu może z powodzeniem grać w ustawieniu z 4 i 3 obrońcami. Ceniony jest również za swój charakter i profesjonalne podejście. Przez niektórych porównywany jest do Ivana Ramiro Cordoby za swoich najlepszych lat.
W sierpniu 2017 roku został wypożyczony do Valencii na dwa lata z obowiązkiem wykupu.