Włoski obrońca w Interze spędził tylko 2 sezony (2004-06). Rozegrał 68 spotkań. W 2006 roku na zasadzie wolnego transferu odszedł do Milanu. Kariera Favalliego obfitowała w sukcesy. Podczas 18 lat występów w Lazio, Interze i Milanie dwukrotnie był Mistrzem Włoch, 5 razy zdobywał Puchar Włoch, 3 razy Superpuchar Włoch, 2 razy Superpuchar Europy, oraz po razie wygrywał Ligę Mistrzów, Puchar Zdobywców Pucharów i Klubowe Mistrzostwo Świata.